堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，预备在落成之日举行演奏会。但是在演奏会之前，堂本音乐学院的先生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。园子带着柯南一行人来听排演，看法了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有相对音感的秋庭也末尾遭遇到风险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。但是就是从这些事情中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭扫除在凶杀外。这边曾经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时危在旦夕，相对音感成为了独一的救命线索。柯南找到了爆炸的逻辑，要在罪犯引爆最后一个炸弹前，把他找出来。